参考资料：
步骤：
- 分别提取分子A、分子B和分子A-B的xtc轨迹及gro文件；
- 利用gro文件生成分子A、分子B和分子A-B的tpr文件；（理论上可以通过convet-tpr实现，但可能因为原tpr中能量组、温度组等的设置而出现问题，所以建议重新生成tpr文件）
- 利用xtc来-rerun分子A、分子B和分子A-B的tpr，命令如：
gmx mdrun -v -deffnm lys -rerun lys.xtc； - 将分子A-B的LJ(SR)+Coulomb(SR)+LJ.Disp+Coulomb.recip减去分子A和分子B的。
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